Disk 2: Persistence
Druhé DVD přináší do světa MGS novinku v podobě online modu, který je však pro hráče již nevyužitelný (servery jsou uzavřeny z důvodů MGO2). Dále ale obsahuje Duel Mode, ve kterém se můžete utkat s bossy nebo po boku Evy utéct z Groznyj Gradu na motorce, kdykoliv se Vám zachce. Na výběr máte ze dvou režimů a to "Normal Mode" a "Special Mode", které se od sebe liší obtížností. Dalším bonusem je Secret Theatre, který nabízí krátká videa zesměšňující některé vážné momenty ve hře. Za zmíňku stojí také vylepšený Snake vs. Monkey mode, který byl od původní verze obohacen o dva nové levely. No a tím největším bonusem jsou lehce upravené originální díly Metal Gear a Metal Gear 2: Solid Snake kdysi vydané pro MSX. A nakonec malá poznámka. Některé novinky obsažené v Subsistence již byly zahrnuty do evropské verze Snake Eater. Jde o nové levely ve Snake vs. Monkey a Duel Mode.
Metal Gear série
Díky MGS3: Subsistence máte možnost zahrát si i ty nejstarší díly célé ságy. Pro fanouška série je to povinnost, pro příležitostního hráče také. Během hraní můžete zažít i po tak dlouhé době téměř stejné pocity jako kdysi v dobách, kdy virtuální svět ještě nepoznal třetí rozměr. Už z tohoto důvodu stojí za zvážení, zda neprodat MGS3: Snake Eater do bazaru a vyměnit ho za Subsistence.
Duel Mode
V Duel Modu budete mít možnost zopakovat si jakýkoliv větší souboj z MGS3, kdykoli se Vám zachce. Máte na výběr mezi obtížnostmi "Normal Mode" a "Special Mode", přičemž Normal je jednodušší než Special. V Normal Modu totiž budete mít téměř neomezenou munici a není tak těžké dosáhnout prvního místa. Naproti tomu Special Mode je mnohem obtížnější. Je to způsobeno hlavně minimálním počtem munice.
Snake vs. the Ocelot Unit
Snake vs. Ocelot
Snake vs. The Pain
Snake vs. The Fear
Snake vs. The End
Snake vs. The Fury
Snake vs. Volgin
Snake a EVA na motorce vs. pronásledovatelé
Snake vs. Shagohod
Snake vs. The Boss
Snake vs. Monkey
Zde se chopíte role Solida Snaka a na požadavek Roye Campbella máte za úkol pochytat všechny uprchlé opičky ze hry Ape Escape. V podstatě se jedná o vtipnou náhražku VR misí.
Return of the Living Apes
The Apes of Wrath
+ původní úrovně
Secret Theatre
Secret Theater jsou krátké vtipné filmečky a nezapomenutelná videa zesměšňující některé vážné momenty ve hře.
Close Call
He's Still Got It
Metal Gear Raiden: Snake Eraser
The Beginning is the End
Get Down!
Gotcha this Time
Payback
Cat-Like Behavior
The Joy
Metal Gear S...
The Quick Version
I Read them for the Articles
Diehard
Made in U.S.A
The Ultimate Weapon
Basashi
